近来，中国科学院天津工业生物技能研讨所水雯箐研讨组成功树立了对根据MSE办法的无标定量蛋白质组学数据的新剖析流程。

  超高效液相色谱-高分辩质谱(UPLC-HRMS)渐渐的变成了蛋白质组学、代谢组学以及药代动力学研讨中的一项中心支撑技能，经过对不同生物样品的定量研讨能够全面、精细地表征该生物系统的生理特性及猜测功用。在用于蛋白质组学的质谱剖析中，无标定量以其稳定性和安全性逐步占有了首要位置。MSE办法是由Waters公司开发的使用在Q-TOF类型质谱仪器上的一种组学数据收集办法，作为一种数据独立获取(DIA)办法，它能大大的提高无标蛋白质定量的准确性和动态规模。但由于它特别的输出格局方式，一些致力于剖析数据依靠型(DDA)数据的常用开源软件不能对MSE 数据来进行进一步的剖析。

  近来，中国科学院天津工业生物技能研讨所水雯箐研讨组成功树立了对根据MSE办法的无标定量蛋白质组学数据的新剖析流程。在该研讨中，结合开源软件Skyline和计算软件Diffprot树立起的作业流程，完成了对无标定量MSE质谱数据的定量剖析。经过对磷酸化肽段和全细胞质蛋白质组定量数据的剖析使用，验证了新开发流程的可靠性、稳定性、准确性和通明快捷的处理流程。别的，该研讨立异性地发现改善后的新流程也能使用于对小分子化合物的大规模定量剖析，在蛋白质配体相互作用试验中，研讨人员使用该新流程发现了针对药物靶点蛋白NDM1的新式小分子配体。

  该研讨取得国家自然科学基金和天津自然科学基金项目的支撑，相关研讨成果现已发表于Proteomics (2014,14:169–180)，天津工生所和南开大学联合培育的研讨生刘姗姗为榜首作者。